La escasez de existencias suele ir a la par de los excesos de existencias que acarrean pérdidas por caducidad. La escasez de existencias se debe a insuficiencias de todo el sistema de abastecimiento: por ejemplo, la falta de divisas a nivel nacional puede limitar las adquisiciones de medicamentos o materias primas; en la periferia, las entregas se reciben independientemente del estado de las existencias y del consumo; o también, las tarifas de venta de los medicamentos son más bajas que los costos de adquisición y de gestión y no permiten renovar las existencias. Para que no haya escasez de existencias, las entregas deben permitir que las existencias se mantengan por encima de cierto nivel: las existencias de seguridad. Ello supone varias condiciones: conocer, en todo momento, el estado de las existencias y su rotación (las entradas y las salidas) y sobre todo poder decidir en cuanto a las entradas y las salidas de las existencias. Los instrumentos de gestión de las existencias que permiten tener datos adecuados son bien conocidos. El estado y la rotación de las existencias sólo pueden conocerse precisa y rápidamente en la periferia, allí donde se encuentran las existencias, pero ese conocimiento sólo se obtendrá si es útil para las decisiones: si va acompañado de un poder de decisión. Por lo tanto, aquí insistiremos en ese poder de decisión: está vinculado al financiamiento.

El medio más seguro para que exista, en la periferia, un verdadero poder de decisión es haciendo que ese nivel disponga de medios de financiamiento para pagar el reabastecimiento. Esos medios los pueden proporcionar diferentes fuentes: los pacientes, un sistema de pago por adelantado, un seguro de enfermedad o una subvención pública en forma de fondos desembolsados o en forma de un presupuesto abierto en una central de compra. Por el contrario, cuando una central de compra envía medicamentos sin orden previa de la periferia, difícilmente puede ajustar las cantidades a las necesidades, puesto que no está en condiciones de saber cuál es el estado de las existencias y sus variaciones.

Si por cada salida de un medicamento de las existencias hay un pago a un precio que cubre los costos, la farmacia tiene medios para reabastecerse. Sin embargo, en muchos casos, el financiamiento es insuficiente para satisfacer las necesidades.

Si la dispensación de los medicamentos es gratuita o a un precio bajo, las salidas de medicamentos no proporcionan suficiente dinero para cubrir el costo de reabastecimiento; en otros casos, el monto de la liquidez no permite adquirir unas existencias suficientes. En tal caso, hay que establecer un sistema de gestión de la escasez de existencias, es decir, poder decidir en cuanto a las prioridades ya sea entre pacientes (siempre muy difícil desde un punto de vista ético) o entre medicamentos, por ejemplo, tratando de abastecerse por prioridades en cantidades suficientes de medicamentos vitales. ¿Es mejor tener que negarse a proporcionar al paciente medicamentos almacenados disponibles porque éste no tiene dinero o no dárselos a nadie porque no los hay almacenados?