Complexité du problème
Les facteurs qui influent sur l'utilisation des médicaments sont nombreux et interdépendants. Il est extrêmement difficile de modifier des pratiques complexes qui plongent leurs racines dans des croyances culturelles et sociales et qui sont façonnées par la connaissance, les attitudes, l'infrastructure et les intérêts économiques. Aucune approche unique ne pourra vraisemblablement apporter une réponse au problème, et certaines interventions sont susceptibles de produire des effets involontaires. Il faudra plutôt recourir à un ensemble de stratégies adaptées aux besoins des divers groupes et environnements.
Intérêts contradictoires
Les politiques de promotion de l'usage rationnel des médicaments sont souvent controversées et engendrent l'hostilité pour diverses raisons. Les prescripteurs, notamment ceux qui délivrent également les médicaments, ont peut-être un intérêt financier à prescrire davantage de médicaments ou les médicaments offrant la marge bénéficiaire la plus élevée. Ils sont susceptibles d'être irrités par toute atteinte à leur liberté de prescrire. Il est également possible que le fait de prescrire de nombreux médicaments nouvellement commercialisés ou onéreux leur confère un certain prestige. Les pharmaciens et les vendeurs de médicaments ont un intérêt financier à augmenter le volume de leurs activités, les producteurs souhaitent augmenter leurs ventes, et leurs pratiques commerciales peuvent aller à l'encontre des objectifs de l'usage rationnel des médicaments. Les consommateurs et les prescripteurs estiment peut-être que les interventions destinées à encourager l'usage rationnel des médicaments ont pour but de réduire les coûts et non d'améliorer les traitements. Il est donc essentiel de recenser et d'étudier l'ensemble de ces intérêts, lesquels constituent des obstacles fondamentaux au changement.
Manque d'information indépendante
Dans de nombreux pays, l'accès à une information pharmaceutique régulière et à jour est inexistant ou très restreint et les agents de santé et les consommateurs dépendent presque entièrement des sources d'information commerciales. De ce fait, dans la plupart des pays en développement, les prescripteurs et les consommateurs sont mal informés. Même lorsque ceux-ci ont accès à des bulletins pharmaceutiques indépendants, à des centres d'information pharmaceutique et à d'autres sources d'information, ils sont parallèlement exposés à d'énormes quantités d'informations commerciales. Ce déséquilibre de l'information entrave considérablement les politiques de promotion de l'usage rationnel des médicaments.
Promotion pharmaceutique inappropriée
Si les médicaments peuvent être bénéfiques, ils peuvent aussi être nocifs, et leur promotion doit donc être strictement encadrée afin de protéger le public. La promotion inappropriée de produits pharmaceutiques demeure un problème dans les pays en développement comme dans les pays développés. Les problèmes sont liés à l'exactitude scientifique et à l'équilibre de l'information, aux incitations commerciales abusives à l'intention des prescripteurs et des personnes délivrant les médicaments, à l'absence d'information complète sur les produits, aux présentations trompeuses des délégués médicaux, et aux activités promotionnelles déguisées en opérations scientifiques et éducatives.
Possibilité de se procurer sans restriction des médicaments normalement délivrés sous ordonnance
Dans de nombreux pays, les médicaments qui exigent un suivi médical et une ordonnance peuvent être obtenus sans difficulté auprès des vendeurs de médicaments et dans les pharmacies. Cette situation entraîne un usage inapproprié de médicaments et se solde par du temps perdu avant que la maladie ne soit diagnostiquée et traitée correctement. La possibilité de se procurer des médicaments sans restriction peut aussi contribuer à l'apparition de résistances à des médicaments, entraîner des interactions pharmaceutiques et des effets indésirables et constituer une mauvaise utilisation des maigres ressources des ménages.