Se recomiendan los procedimientos de identificación con cromatografía en capa delgada para la detección de medicamentos falsificados. Numerosos estudios han demostrado los usos múltiples de estos métodos. Pueden emplearse para la identificación de sustancias medicamentosas, la estimación del contenido de sustancia medicamentosa y la detección de sustancias relacionadas que podrían considerarse impurezas. Los procedimientos de cromatografía en capa delgada son más específicos y selectivos que las pruebas básicas de la OMS para la identificación de sustancias medicamentosas (ver sección 9.2) y están sujetos también a menor interferencia por los excipientes.

Un producto falsificado puede contener los ingredientes activos correctos pero en cantidades diferentes a las declaradas. En respuesta a medidas eficaces contra la falsificación, los falsificadores a menudo introducen cantidades pequeñas de las sustancias farmacéuticamente activas genuinas en las formas farmacéuticas. Esto ofrece resultados de identificación positivos y así los falsificadores intentan contrarrestar o confundir el proceso de detección. En tales casos, las pruebas básicas son inadecuadas; por consiguiente, se prefieren los procedimientos de cromatografía en capa delgada dado que suministran información semicuantitativa sobre el principio activo y también sobre las sustancias relacionadas en las formas farmacéuticas.