Dentro de los sistemas de seguros de salud, las razones para incorporar medidas y estrategias que promuevan el uso racional de los medicamentos incluyen tanto los criterios éticos, terapéuticos como económicos. Es importante que cada individuo reciba el mejor tratamiento posible, pero es también fundamental que el tratamiento tenga un costo asequible para la sociedad. Los costos excesivos del uso irracional del medicamento pueden imposibilitar la viabilidad de un sistema de seguridad social.

La regulación sobre el uso de medicamentos por el sistema de seguros de salud apunta prioritariamente hacia la racionalización del uso intrahospitalario, del que Estados Unidos de América es pionero, y se refiere a la aplicación del sistema de distribución unidosis, de la cual se cuenta con experiencias exitosas en hospitales colombianos y en Guatemala. Por otra parte, muchas prácticas de comercialización de las compañías farmacéuticas dan lugar a un uso inapropiado del medicamento que los sistemas de salud tienen que regular cuidadosamente para poder asegurar la viabilidad financiera del sistema.