Los países reunidos en el Mercosur, liderados por Argentina y Brasil, se caracterizan por tener una Industria farmacéutica muy fuerte y un sector farmoquímico de relativa importancia. La participación de los industriales en las deliberaciones del proceso de integración ha llevado a que los acuerdos se orienten principalmente hacia la armonización de las normas de fabricación. Buena parte del trabajo se ha centrado en armonizar las Normas de manufactura correcta, adoptando también las de la OMS; otra buena parte de los esfuerzos se ha orientado hacia la armonización de criterios en inspección de plantas y hacia el registro de plantas farmoquímicas. Se ha iniciado también recientemente el proceso de armonización del registro sanitario.